黑荞麦酒的制作主要分为发酵法和浸泡法两种。发酵法以黑荞麦米为主料，首先将黑荞麦米淘洗干净，用清水浸泡24小时至米粒手碾即碎。然后将浸泡好的黑荞麦米上甑蒸煮40分钟左右，彻底蒸透后摊凉至30-35摄氏度。接着按比例拌入酒曲（如麦麸曲或大曲），装入容器中密封发酵。发酵期间前两天需每天打开密封口一次，避免胀气，之后持续发酵约28天即可得到原浆酒。浸泡法则更为简单：将炒制过的黑荞麦粒直接放入高度白酒中，密封浸泡1-3个月，待酒液呈琥珀色、麦香浓郁时即可饮用。也可以将黑荞麦与黑糯米、黑小米等杂粮混合酿造，以丰富酒体口感。
黑荞麦酒最突出的功效在于保护心血管。黑荞麦富含生物类黄酮，主要成分是芦丁（又名维生素P），这种物质能软化血管、改善微循环、降低毛细血管脆性。同时，黑荞麦酒中的不饱和脂肪酸可以降低血液中的胆固醇和甘油三酯含量，减少血液粘稠度，抑制血小板凝聚，从而预防血栓形成。研究表明，黑荞麦中的黄酮类成分对高血压、高血脂人群有积极的辅助调节作用。
黑荞麦酒对糖脂代谢具有调节作用。黑荞麦中含有D-手性肌醇和芦丁等活性成分，能够加强胰岛素的外周作用，帮助稳定血糖水平。芦丁与膳食纤维协同作用，可延缓碳水化合物的吸收速度。在降脂方面，黑荞麦酒有助于降低血清总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇（“坏胆固醇”）水平，对预防动脉硬化有积极意义。
黑荞麦酒富含多酚类化合物和硒元素，具有较强的抗氧化能力。硒元素能够保护、修复、活化细胞，具有抗衰老和增强免疫力的功效。多酚类化合物则能抑制血管内皮细胞的氧化损伤，促进细胞的再生和修复。此外，黑荞麦中还含有18种氨基酸、丰富的B族维生素和矿物质，这些营养成分有助于促进免疫细胞的生成和活化，提高人体抵抗力。
适量饮用黑荞麦酒有助于增强消化功能。黑荞麦酒中含有多种酶类和有机酸，能促进胃肠道消化酶的分泌，帮助食物消化吸收。同时，黑荞麦中的纤维素和果胶物质可以促进肠道蠕动，帮助排出代谢废物。黑荞麦酒还具有益气提神、缓解疲劳的作用，适合在劳累后适量饮用。
黑荞麦酒虽有多重保健功效，但毕竟含有酒精，必须适量饮用，不可过量。严重高血压患者、酒精过敏人群、孕妇和儿童不宜饮用。正在服用降糖药或降脂药的人群，饮用前应咨询医生意见，以免与药物产生相互作用。另外，自制黑荞麦酒时需注意容器和环境的清洁卫生，避免杂菌污染。