黑小麦是一种营养价值极高的谷物。研究表明，黑小麦在营养成分上全面优于普通小麦，其蛋白质、膳食纤维、钙、维生素K以及总酚、总黄酮含量和抗氧化活性都显著更高，总酚含量可达普通小麦的6倍。它还富含B族维生素、铁、锌、硒等多种微量元素。部分品种的蛋白质含量可高达20.09%，总膳食纤维含量达14.11%。这种独特的营养成分构成，为人体健康带来了多重益处。
食用黑小麦对多种慢性疾病具有积极的预防作用，包括心血管疾病、炎症、癌症、糖尿病和肥胖等。其丰富的膳食纤维有助于降低血液中总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇水平，从而保护心血管。研究还发现，黑小麦能够有效预防由2型糖尿病引起的白细胞介素-6和肿瘤坏死因子-α的升高，有助于改善体内炎症状况。在血糖管理方面，黑小麦的淀粉消化速度较慢，部分品种的估计血糖指数较低，有助于延缓餐后血糖上升，对糖尿病患者控制血糖有积极意义。此外，它还能促进排便、改善便秘，其中的抗氧化活性成分有助于清除自由基、延缓衰老，并具有增强免疫力的保健功能。
虽然黑小麦营养丰富，但并非人人适宜。对小麦过敏或患有乳糜泻的人群禁用，以免诱发不良反应。肠胃功能弱者应慎食，因为黑小麦富含膳食纤维，质地相对粗糙，大量食用可能会引起不适。肾脏病人需控制摄入量，因为其蛋白质、钾、磷含量偏高，过量摄入会加重肾脏负担。食用时建议遵循“少量常吃”的原则，从少到多，让肠胃逐步适应。黑小麦可以整粒煮粥、磨粉制作面食，也可与大米搭配煮饭，粗细结合既能改善口感，又能获得全面的营养。