红椒是厨房中用途广泛的食材。红色甜椒常用来为菜肴增色，其鲜艳的红色能提升菜品视觉效果，让人食欲大增。红椒可以切丝、切块或切圈，搭配鸡蛋、肉类、豆腐或土豆快炒，也能作为凉拌菜的配料，或者加入汤羹、炖菜中增加甜味层次。红色辣椒则主要发挥调味作用，切碎后加入蘸料、炒菜或煮汤，提供辣味刺激。无论是哪种红椒，都能在丰富口感的同时减少盐和刺激性调味品的使用量。
红椒是许多酱料的核心原料。烤红椒去皮后与松子、大蒜、橄榄油一同打碎，可制成西班牙风味romesco酱，适合搭配烤肉、海鲜或抹面包。红椒与番茄、洋葱熬煮后打泥，做成红椒浓汤底，也可作为意大利面的酱汁。将红椒切碎与醋、糖、蒜末一同腌制，可制成酸甜微辣的红椒酱，佐粥或配馒头都很合适。市面上常见的红油辣椒、剁椒酱也主要以红辣椒为原料，提前制作好放入冰箱，可长期保存备用。
红椒在食品工业中应用广泛。红色甜椒经脱水研磨后制成红椒粉，常用于西式香肠、奶酪、方便面调料包的着色和调味，天然且安全。 paprika（红椒粉）就是由干燥红椒碾磨而成，分为甜味和辣味两种，是匈牙利炖肉、西班牙海鲜饭等经典菜肴的必备调料。红椒中的天然红色素——辣椒红素，可作为食品着色剂，添加到饮料、糕点、肉制品中，替代人工合成色素。此外，红椒提取物中的辣椒素也被用于生产辣椒油、辣椒精等调味产品。
红椒富含维生素C、维生素A原、钾和膳食纤维，经常食用有助于补充日常营养缺口。对于需要增强免疫力的人群，红椒是天然的维生素C来源。对于有减脂需求的人，用红椒替代部分高热量配菜，能增加饱腹感并控制总热量。红椒中的辣椒素被应用于一些外用止痛贴膏中，利用其促进局部血液循环、产生温热感的作用，帮助缓解肌肉酸痛和关节不适。不过，食用红椒不能替代正规医疗手段，仅作为辅助健康饮食的一部分。
红椒在家庭中还有一些实用技巧。将红椒切片后冷冻保存，随取随用，可延长保质期至数月。切红椒后手上有辣味，可用食用油搓洗再以洗洁精洗净，比单纯用水更有效。红椒与富含铁的食物（如瘦肉、菠菜）同食，其中维生素C能促进铁的吸收，对预防缺铁性贫血有帮助。此外，红椒的天然甜味可以平衡酸味或苦味，做番茄酱时加一些红椒泥，能降低酸度、增加厚度，这是不少西餐厨师的小窍门。