苦荞面本身带有天然苦味，这是它的特性而非质量问题。苦味来源于苦荞中富含的黄酮类物质（尤其是芦丁），这正是苦荞营养价值的核心所在。不过对于不习惯的人来说，这股苦味确实需要处理。下面介绍几种有效去苦味的方法，同时尽量保留其营养成分。
如果怕苦，在购买时可以选择黑苦荞制作的荞麦面。黑苦荞中芦丁等黄酮类物质的含量更高，口感却反而更甜。相反，普通苦荞面会带有更明显的苦味。购买时注意查看产品说明，选择黑苦荞比例高的品种。
最直接有效的去苦方法是冷水浸泡。将苦荞挂面放入足量冷水中，浸泡30分钟以上，甚至可以放入冰箱冷藏过夜。泡过的面条体积会膨胀变软，捞出后放入沸水中烫几十秒即可捞出。这种方法能有效去除大部分苦味，同时保留营养成分，处理后的苦荞面口感更接近普通荞麦面。
烹饪时通过调味来中和苦味。最常用的方法是多加醋——醋的酸味能有效压制苦味，这也是苦荞面常用来做酸辣口味的原因。加入蜂蜜、白糖或红糖也能中和苦涩，做成甜口凉面或甜味煎饼。此外，辣椒的辛香味、蒜的刺激性气味、芝麻酱的醇厚感，都能掩盖或转化苦味，使其变得更容易接受。
不习惯纯苦荞面味道的，可以将苦荞面与普通面粉或甜荞面混合使用。推荐比例是苦荞面与其他面粉按1:3混合，既能体验苦荞的营养和香气，又不会感觉太苦。这个比例适合做馒头、发糕、煎饼等。做面条时可按1:2的比例混合，和面时加入一个鸡蛋清也能中和苦味。
煮苦荞面时采用“先煮后焖”的方法。将苦荞挂面放入沸水中煮3分钟，然后熄火，盖上锅盖再焖2到3分钟。这种方法比长时间煮制更能去除苦味，同时保持面条的口感。煮好后必须过凉水，洗去表面粘液和苦味物质，这一步不能省略。