荞麦面的煮制时间因面条类型和粗细而异。干荞麦挂面通常需要煮3到5分钟，煮至面条转色、没有硬芯即可。如果是新鲜现做的荞麦面，煮制时间更短，水开后下锅煮2到3分钟即可捞出。较粗的荞麦面或某些品种可能需要煮8分钟左右才能完全熟透。无论哪种类型，当面条颜色从灰白变为浅褐色时，就说明已经熟了。
煮荞麦面时，水量一定要足，至少是面条体积的5倍以上。水烧至完全沸腾后再下入面条，用筷子顺着一个方向轻轻拨散，防止粘连。保持中大火煮制，可以开盖煮，否则水容易溢出。对于干荞麦挂面，建议煮3分钟后熄火，盖上锅盖再焖2到3分钟，利用余温让面条充分熟透。这种方法尤其适合追求弹牙口感的人。
煮好的荞麦面捞出后，一定要过凉水，这是做出好吃荞麦面的关键步骤。将面条放入冰水或凉白开中浸泡20秒左右，用手轻轻揉搓洗去表面的粘液。快速降温能终止余热继续烹煮，同时洗去多余淀粉，使面条更爽滑、有嚼劲。如果想要更筋道的口感，可以过两遍凉水，沥干后摊开稍微晾一下再食用。
对于提前泡软的荞面河漏（饸饹），只需在沸水中煮1分钟即可捞出。如果是荞麦米（用来煮饭或煮粥），则需要提前浸泡3小时以上，然后煮约40分钟至软烂。需要注意的是，甜荞品种的荞麦面可以用开水泡熟，但苦荞品种制作的荞麦面不能用开水泡，必须煮制。
判断荞麦面是否煮熟，最直接的方法是夹起一根尝一下，面条应该没有硬芯、略带嚼劲。如果想吃到偏软的口感，可以再多煮1分钟。荞麦面比普通面条更耐煮，不容易烂，所以不用担心煮过头。煮好的荞麦面如果不立即食用，可以拌少许芝麻油防止干燥，冷藏保存不超过24小时。