穇子本身在传统医学中就被视为一味药食同源的谷物。据《本草纲目》等典籍记载，穇子性味甘温，具有补中益气、厚肠胃的功效。在此基础上酿制的穇子酒，自然也继承了这些特性。传统认为，适量饮用穇子酒有助于改善食少便溏、气短乏力、脘腹胀满等脾胃虚弱引起的不适症状。在民间，桥头穇子酒还常被用来浸泡丁榔果、枸杞、红枣等中药材，以达到“有病治病，无病强身”的养生效果。
现代科学研究为穇子酒的功效提供了更多佐证。穇子中含有丰富的营养成分，主要包括淀粉、矿物质、氨基酸、膳食纤维以及多酚类物质。研究表明，这些成分赋予了穇子及其制品抗氧化、降血糖、改善肠道健康、降血压等多种健康功能。其中，多酚类物质是天然的抗氧化剂，有助于清除体内自由基，延缓衰老；膳食纤维则有助于促进肠道蠕动，改善消化功能。这些发现说明，穇子酒不仅仅是一种传统饮品，更是一种具有一定健康价值的功能性食品原料。
从中医养生角度来看，穇子酒还具备祛风活络、强筋壮骨的作用。酒本身具有温通血脉、助行药势的特性，与穇子结合后，能够更好地发挥活血化瘀、祛除风湿痹痛的功效。传统上，穇子酒被用于缓解腰膝酸软、筋骨疼痛、风湿痹痛等症状。部分地区还认为穇子酒具有补血安神、滋阴壮阳、乌发明目的作用，适合男女饮用。当然，这些功效多源于传统经验和民间认知，实际效果因人而异。
尽管穇子酒有诸多益处，但饮用时仍需注意适量。穇子酒中含有酒精，长期、大量饮用可能会加重肝脏和肾脏的代谢负担，甚至造成损伤。一次性饮用过多则可能导致醉酒，并刺激胃肠道黏膜，引起恶心、呕吐等不适。孕妇、便秘患者、胃溃疡及十二指肠溃疡患者应避免饮用。此外，饮用穇子酒期间需避免服用头孢菌素类药物，以免引起双硫仑样反应，出现眩晕、血压下降甚至休克等严重症状。建议每次饮用量控制在10-30毫升为宜。